ในอนาคตอันไกล มนุษย์ละทิ้งโลกที่ถูกทำลายล้างและเดินทางไปยังอวกาศ อย่างไรก็ตาม เนื่องจากปรากฏการณ์ที่ไม่รู้จักซึ่งขัดขวางไม่ให้พวกมันเดินทางสู่อวกาศ มนุษยชาติจึงกลับมายังโลกเพียงพบว่าไม่เอื้ออำนวยยกเว้นญี่ปุ่น
เพื่อรองรับประชากรมนุษย์ทั้งหมด มิติกระเป๋าถูกสร้างขึ้นทั่วญี่ปุ่นเพื่อที่อยู่อาศัยของประชากร เพื่อหาวิธีกลับสู่อวกาศ มนุษย์จึงเริ่มจำลองประวัติศาสตร์ของมนุษย์ตามพันธสัญญาของหนังสือศักดิ์สิทธิ์ แต่ในปี ค.ศ. 1413 แห่งยุคพันธสัญญา บรรดาประชาชาติในมิติขนาดพกพาได้รุกรานและยึดครองญี่ปุ่น แบ่งอาณาเขตออกเป็นศักดินาศักดินา และบังคับให้ชาวญี่ปุ่นดั้งเดิมต้องจากไป
ตอนนี้เป็นปี 1648 แห่งยุคพันธสัญญา ผู้ลี้ภัยของญี่ปุ่นตอนนี้อาศัยอยู่ในเรือเมือง Musashi ที่ซึ่งมันเดินทางไปทั่วญี่ปุ่นอย่างต่อเนื่องในขณะที่ถูกจับตามองโดย Testament Union ผู้มีอำนาจที่ดำเนินการตรากฎหมายของประวัติศาสตร์ อย่างไรก็ตาม ข่าวลือเรื่องคัมภีร์ของศาสนาคริสต์และสงครามเริ่มแพร่กระจายเมื่อพันธสัญญาหยุดเปิดเผยสิ่งที่เกิดขึ้นต่อไปหลังจากปี 1648
ใช้ประโยชน์จากสถานการณ์นี้ Toori Aoi หัวหน้าสหพันธ์สูงสุดแห่ง Musashi Ariadust Academy และประธานสภานักเรียน นำเพื่อนร่วมชั้นเรียนของเขาใช้โอกาสนี้เพื่อทวงคืนบ้านเกิด ดูอนิเมะ
